为了防止兽药残留，确保食品的安全质量，在无公害养殖中必须遵循农业部颁布的与畜禽、水产和蜜蜂养殖用药有关的兽药使用准则，合理选择兽药种类、剂型，严格遵守使用方法和剂量、使用对象、休药期。
动物疾病以预防为主，严格按《动物防疫法》和无公害饲养兽医防疫准则的规定进行预防，建立严格的生物安全体系，防止动物发病和死亡，及时淘汰有病畜禽，最大限度地减少化学和抗生素的使用。必须使用兽药时应有兽医处方并应在兽医指导下进行，经确诊疾病和致病菌的种类后，再对症下药，避免滥用药物。进行预防、治疗和诊断疾病所用的兽药必须符合《兽药典》、《兽药规范》、《兽药质量标准》、《兽用生物制品质量标准》、《进口兽药质量标准》和《饲料药物添加剂使用规范》等的相关规定。所有兽药必须来自具有《兽药生产许可证》和产品批准文号的生产企业，来自具有《兽药经营许可证》和《进口兽药许可证》的供应商。所用兽药的标签应符合《兽药管理条例》的规定。
